«Бока Хуниорс»

Гаго, который пришёл во взрослую команду клуба «Бока Хуниорс» из юношеской, дебютировал в основном составе 5 декабря 2004 года в игре с «Кильмесом», которая завершилась победой «Хуниорс» со счётом 1:0. Несмотря на молодой возраст, он быстро стал основным игроком полузащиты клуба, и его стали часто сравнивать с Фернандо Редондо. Его уверенная игра вызвала интерес к нему со стороны таких испанских клубов, как «Реал Мадрид» и «Барселона».
«Реал Мадрид»

15 ноября 2006 года президент «Реала» Рамон Кальдерон одобрил подписание Гаго и его соотечественника Гонсало Игуаина. Контракт Гаго с «Реалом» был подписан 19 декабря 2006 года, сумма трансфера составила 20 400 000 евро.

Дебют Гаго в «Реале» состоялся 7 января 2007 года в матче испанской Примеры против «Депортиво». Реал победил в этой игре со счётом 2-0. После ряда ошибок, совершённых им на поле, Гаго был заменён в своём первом матче на Роналдо. Через неделю, в следующей с «Сарагосой», Гаго подтвердил свою значимость на футбольном поле. Его игра доставляла неудобства соперникам, он демонстрировал отличное ви́дение поля и обострял атаки своей команды. «Реал» обыграл «Сарагосу» со счётом 1:0 благодаря голу Руда Ван Нистелроя.

20 мая 2007 года в матче с «Рекреативо» при счёте 2:2 «Реал» вышел вперёд в счёте после голевой передачи Гаго на Роберто Карлоса и в итоге выиграл тот матч со счётом 3:2, что позволило ему догнать по очкам «Барселону», а затем и выиграть чемпионат.

Во второй сезон в мадридском «Реале» Гаго продолжал демонстрировать качественную игру, что позволило ему занять своё место в полузащите «Реала», вытеснив из основного состава Мамаду Диарра.